IOCB Prague - Institute of Organic Chemistry and Biochemistry

08/10/2026

🧪 Carboxylic acids are abundant, stable, and widely available building blocks in organic chemistry. Turning them into reactive radicals through decarboxylation offers an attractive way to form new carbon–carbon bonds under mild conditions.

Researchers from IOCB Prague, the University of Regensburg, and the University of Strathclyde have now developed a photo(electro)chemical strategy for engaging native carboxylic acids in decarboxylative functionalization. The study includes Luigi Dolcini, Lucie Ludvíková, Jakub Krištof, Michał Domański, Mattia Lepori, Soňa Boháčová, Daniel Bím, Tomáš Slanina, and Joshua Philip Barham.

The team applied the method to reactions of aliphatic carboxylic acids with nitrogen-containing heteroarenes, demonstrating a net oxidative process and assessing the reaction scope, scale-up, and green chemistry metrics.

To understand how the reaction works, the researchers combined transient absorption spectroscopy, radical trapping, EPR experiments, and computational analysis. These studies revealed a key role of the protic solvent, which helps activate the excited dibenzo-fused heterocyclic ketone catalyst.

The results point to a solvent-gated excited-state proton relay mechanism, where proton and electron transfer processes work together to activate native carboxylic acids and generate radical intermediates for further functionalization.

📓 Read the paper:
Dolcini, L.; Ludvíková, L.; Krištof, J.; Domański, M.; Lepori, M.; Boháčová, S.; Bím, D.; Slanina, T.; Barham, J. P. Engaging Native Carboxylic Acids via Solvent-Gated Proton Relay for Photo(electro)chemical Decarboxylative Functionalization. Chemical Science 2026. DOI: 10.1039/D6SC05552D

07/10/2026

🗣️ Jak se spolupracovalo s budoucím nobelistou? I o tom ve speciálu ČT24 mluvil Ivo Starý z našeho ústavu – v minulosti se totiž jeho vědecká dráha protnula s dráhou Kensa Soaiho, jednoho ze dvou chemiků oceněných dnes za výzkum nelineárních jevů a autokatalýzy v asymetrické organické syntéze.

Jak můžete vidět na toto snímku, Prof. Soai byl také v roce 2010 hostem Ireny G. Staré a tehdejšího ředitele Zdeňka Havlase na půdě našeho ústavu, kde přednášel v rámci našeho cyklu Zvaných přednášek.
___

🇪🇺 What was it like to work with a future Nobel laureate? Ivo Starý from our institute spoke about his experience in a Czech Television special – earlier in his career, he worked with Kensō Soai, one of the two chemists awarded today for research on nonlinear effects and autocatalysis in asymmetric organic synthesis.

As seen in this photo, Prof. Soai also visited IOCB Prague in 2010 as a guest of Irena G. Stará and then-director Zdeněk Havlas, giving a lecture as part of our Invited Lecture Series.

07/10/2026

👐 Ivo Starý z našeho ústavu byl dnes hostem Studia ČT24.

Mluvil o letošní Nobelově ceně za chemii, kterou získali Francouz Henri B. Kagan a Japonec Kensō Soai za objevy spojené s asymetrickou organickou syntézou a chiralitou.

Více na odkazu v komentáři. 📲

07/10/2026

🧪 Applications are now open for the 2027 MIT–Czech Republic IOCB Foundation Seed Fund.

The program supports early-stage collaborations between Czech researchers and their colleagues at MIT, with funding of up to USD 25,000 per project.

More information is available from IOCB Foundation's original post.

Applications for the 2027 MIT-Czech Republic IOCB Foundation Seed Fund are now open!

Organized by MIT Center for International Studies and financed by IOCB Foundation with USD 100,000 annually, the program supports early-stage collaborations between researchers from Czech universities and research institutes and their colleagues at MIT. Selected projects receive up to USD 25,000 to finance initial working meetings and research visits.

More information and how to apply ⤵️

06/10/2026

🧪 Nadace Experientia vyhlašuje další ročník soutěže o tříletý startovací grant.

Grant ve výši 6,6 milionu korun je určen mladým vědkyním a vědcům, kteří chtějí po zahraniční zkušenosti nastartovat vlastní nezávislý výzkum v Česku.

Žádosti je možné podávat do 15. února 2027. Vice v původním příspěvku Experientia.

🚀 Vyhlašujeme další ročník soutěže o startovací grant!

Přeměňte své zahraniční zkušenosti v nezávislou vědeckou kariéru. Zažádejte si o tříletý startovací grant ve výši 6,6 milionů korun a založte si vlastní výzkumnou skupinu.

✅ Kdo může o grant žádat? Mladí vědci a vědkyně, kteří mají nejdéle 7 let po ukončení Ph.D. studia, absolvovali minimálně roční zahraniční stáž a mají originální projekt v oboru organické, bioorganické nebo medicinální chemie.

📅 S novým ročníkem měníme uzávěrku přihlášek. Žádosti nám můžete posílat nejpozději do 15. února 2027.

🔗 Podrobné informace, pravidla, checklist a formuláře najdete na https://www.experientia.cz/pro-zadatele/start-up-granty/.

06/10/2026

🧠 The universe or the brain? Both have much in common.

The green curved arrows in the picture are fluorescently labelled nerve cells - neurons in the mouse brain, specifically the hippocampus, in their typical arrangement, as they were photographed by Vilém Charvát from Lenka Maletínská Group.

The hippocampus is a key region of the brain that plays an important role in various cognitive functions, especially those related to learning and memory. The hippocampus is essential for the formation of memory and the formation of new memories, which is crucial for learning and remembering facts. It is involved in spatial navigation, plays a role in the regulation of emotions, but it is also one of the areas of the brain where neurogenesis - the formation of new neurons - takes place even in adulthood. In Alzheimer's disease, the hippocampus is among the first areas of the brain to suffer from damage.

With the help of fluorescence microscopy and the specific labelling of various structures in the tissue, here neurons (green), newly formed neurons (bright red) and nuclei of other cells (blue), we can observe and describe the pathological features of various diseases, but also the effects of substances that could be used as potential drugs.

The photo was taken under the fluorescence microscope Olympus IX83 pE-300 lite, 20x.

A limited edition T-shirt with the motive of this image can be found on our e-shop, link in comments. 📲
___

🇨🇿 Vesmír nebo mozek? Oba mají mnoho společného.

Zelená zatočená šipka na obrázku jsou ve skutečnosti fluorescenčně označené nervové buňky – neurony v myším mozku, konkrétně v hipokampu, ve svém typickém uspořádání, které zachytil Vilém Charvát ze skupiny Lenky Maletínské.

Hipokampus je klíčovou oblastí mozku, která hraje důležitou roli v různých kognitivních funkcích, zejména těch, které souvisejí s učením a pamětí. Hipokampus je nezbytný pro formování paměti a vytváření nových vzpomínek, což je zásadní pro učení a zapamatování faktů, podílí se na prostorové navigaci, hraje roli při regulaci emocí, ale také je jednou z oblastí mozku, kde i v dospělém věku probíhá neurogeneze – tvorba nových neuronů. Při Alzheimerově chorobě je hipokampus mezi prvními oblastmi mozku, která utrpí poškození.

S pomocí fluorescenční mikroskopie a specifického označení nejrůznějších struktur v dané tkáni, zde tedy neurony (zelené), nově vzniklé neurony (jasně červené) a jádra ostatních buněk (modré), jsme schopni sledovat a popsat patologické znaky nejrůznějších onemocnění, ale také účinky látek, které by se daly využít jako potenciální léčiva.

Fotka byla pořízena pod fluorescenčním mikroskopem Olympus IX83 pE-300 lite, zvětšení: 20x.

Tento snímek si můžete pořídit také na tričku z našeho ústavního merche. Více v komentářích. 📲

🔵

06/10/2026

🧪 NTK od října spouští tradiční sérii bezplatných webinářů k odborným zdrojům, psaní vědeckých článků, práci s daty, citování, AI i akademické integritě.

Webináře jsou zdarma a otevřené studentům, doktorandům, začínajícím výzkumníkům i všem zájemcům. Program a registraci najdete na webu NTK.
___

🇪🇺 From October, NTK is launching its traditional series of free webinars on specialist resources, academic writing, data management, citation practices, AI and academic integrity.

The webinars are free and open to students, PhD students, early-career researchers and anyone else interested. You can find the programme and registration details on the NTK website.

/ENG below ⤵️/ Od října pro vás chystáme tradiční sérii bezplatných webinářů a je z čeho vybírat!

Ať už:
🔎 hledáte ty správné odborné zdroje
✍️ píšete svůj (první) vědecký článek
🤖 přemýšlíte, jak smysluplně využít AI
📊 začínáte pracovat s výzkumnými daty
📚 potřebujete si ujasnit citování
nebo ⚖️ řešíte otázky akademické integrity – každý si najde něco užitečného.

Můžete se těšit i na pokračování NTK Coffee Lectures! ☕ Každou středu od 12:30 nabídneme 15–20 minut na jedno úzce zaměřené téma. Začínáme 7. října.

Webináře jsou zdarma a jsou otevřené studentům, doktorandům, začínajícím výzkumníkům, ale i ostatním, které téma zajímá.

Na webináře není potřeba členství v NTK. 👉 Program a registrace: https://www.techlib.cz/cs/83785

//

Starting October, NTK is launching its traditional series of free webinars covering various topics from working with scientific resources and academic writing to AI, research data, and publishing.

Whether you are:
🔎 looking for the right scholarly sources
✍️ writing your (first) scientific article
🤖 exploring how to use AI in academia
📊 getting started with research data
📚 working on citations
or ⚖️ dealing with academic integrity – there’s a session for you.

We are also continuing our NTK Coffee Lectures! ☕ Join us every Wednesday at 12:30 p.m. for a focused 20-minute webinar on one specific topic. Starting October 7.

All webinars are free and open to students, early-career and senior researchers, but also to everyone interested in the topic.

No NTK membership required. 👉 Check out the program and register: https://www.techlib.cz/en/83809

05/10/2026

⚗️ Researchers led by Paulo Paioti from IOCB Prague have developed a new catalytic macrocyclization strategy for synthesis of cyclic molecules that are difficult to obtain by conventional methods. The approach enables the direct formation of sterically hindered carbon–nitrogen bonds through an intramolecular nucleophilic aromatic substitution (SNAr) reaction and provides access to highly strained atropisomeric macrocycles, medium-sized rings and atropopeptides.

The key innovation lies in the way the reaction generates and regenerates a strong base. In many base-catalyzed substitution reactions, catalyst turnover is inefficient because the leaving group is not sufficiently basic. The new method avoids this limitation through use of a fluoride catalyst in combination with an organosilane, described by the authors as a base-embedding electrophile, allowing the active base to be regenerated through a different catalyst turnover mechanism. Such and other mechanistic aspects have been studied experimentally and computationally with Daniel Bím from UCT Prague.

The method makes it possible to construct strained medium-sized rings and macrocycles directly from linear precursors with a N-heterocycle head and an aryl fluoride tail. Many of the resulting compounds have three-dimensional shapes and stereochemistry that are of particular interest in medicinal chemistry.

The researchers applied the reaction to direct cyclization of tryptophan-containing peptides. This enabled the synthesis of structurally and stereochemically diverse atropopeptides inspired by naturally occurring ribosomally synthesized and post-translationally modified peptides (RiPPs), known as RiPPs. Preparation of these cyclic peptides will enable bioactivity screenings in search of compounds with anticancer and antibacterial properties. Such studies will also shed light on the impact of atropisomerism on the molecules’ pharmacological properties.

The work impacts synthesis and catalysis broadly. It brings attention to a new way of synthesizing cyclic heterobiaryl molecular architectures available for drug discovery, and to a concept in catalysis which is to inspire other challenging and useful substitution and addition reactions.

Most of the synthesis resulted from collaborative effort within the Paioti group, involving PhD students Alireza Abbasi Kejani and Paritosh Dey, and Marie Skłodowska-Curie postdoctoral fellow Nicholas Stillman and undergraduate student Daniel de Andrade.

📓 Read the paper
Abbasi Kejani, A.; Dey, P.; Stillman, N. H.; Andrade, D. M.; Šimek, M.; Dračínský, M.; Bím, D.; Paioti, P. H. S. Synthesis of Large- and Medium-Sized Heterobiaryl Atropisomeric Rings and Atropopeptides by Catalytic Intramolecular SNAr. Angew. Chem. Int. Ed. 2026, e8290035.
DOI: 10.1002/anie.8290035

05/10/2026

🎓 Milan Štefek from Radim Nencka’s group has successfully defended his PhD dissertation at the Faculty of Science, Charles University!

His dissertation, Design, synthesis and biological evaluation of nucleoside-based inhibitors of viral methyltransferases, focuses on the development and study of nucleoside-based compounds targeting viral enzymes.

Congratulations on this significant milestone – and we wish Milan the very best of luck in everything that lies ahead!

02/10/2026

🖌️ Murál vzniklý k příležitosti nedožitých 90. narozenin jednoho z nejvýznamnějších českých vědců byl odhalen 1. září. Najít ho můžete na zdi našeho ústavu v Dejvicích.

Podle Sashy Chaginy právě pouliční umění často nejlépe odráží stav kultury v daném místě.